观察宝石的净度是很多宝石鉴别时都会运用的方法，这是宝石在生成过程中产生的标志，往往能直观的反应出宝石的一些情况。作为普通的消费者，在购买碧玺的时候，如果不借助器械和设备对商品进行鉴别，那么最直接的方法就是用肉眼观察
经过填充处理的碧玺可见典型充填特征，裂隙或空洞，偶见气泡，沿裂隙可见“闪光效应”。真正达到全净体的碧玺很少，而且价值很高。天然碧玺的晶体内往往包含有很多包裹体或者内含物，如果仔细观察的话，一些用肉眼就可以观察到，但是要分清包裹体的类型还是要借助放大镜，包裹体主要有气液、管状、平行线状三种