经过2～3个月的适应，绝大部分大熊猫已经对新的环境完全适应，当年就有13只大熊猫幼崽在这里出生，2009年又新出生16只，预计今年新生大熊猫幼崽会达到或超过这个数量。该基地副主任汤纯香教授介绍，汶川大地震发生后，从2008年５月到９月，共有60余只大熊猫分９批从卧龙转移到碧峰峡
这项研究还将扩大到整个大熊猫种群，当发现一个区域内野生大熊猫种群数量下降、近亲繁殖加剧时，就可利用优质大熊猫冻精，对个别雌性大熊猫人工授精，以保证其种群繁育数量和质量的提升。基地研究人员通过谱系管理和遗传分析，建立起四川和陕西、国内与国外的大熊猫繁育体系，互相交换大熊猫冻精、成年个体或亚成体，避免大熊猫近亲繁殖。每只大熊猫皮下埋着的晶片，记载着大熊猫身份、谱系信息。汤纯香介绍，为保证大熊猫种群质量，目前基地已经着手对圈养大熊猫实施“优生优育”计划